Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms