Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms