Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms