Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms