Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms