Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms