Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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