Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL40Q2TBA0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms