Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Q1T7F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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