Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms