Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms