Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NRF1Q16656 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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