Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXNQ16595 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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