Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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