Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms