Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLFQ16534 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLFQ16534 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLFQ16534 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLFQ16534 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLFQ16534 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms