Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCEA2Q15560 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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