Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms