Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
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