Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms