Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms