Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IHHQ14623 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IHHQ14623 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IHHQ14623 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms