Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms