Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms