Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2Q13563 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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