Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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