Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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