Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IKZF1Q13422 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IKZF1Q13422 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms