Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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