Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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