Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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