Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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