Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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