Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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