Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TRAF2Q12933 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TRAF2Q12933 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TRAF2Q12933 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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