Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms