Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIF5AQ12840 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms