Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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