Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms