Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms