Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms