Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms