Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms