Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms