Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms