Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms