Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEX3Q00994 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms