Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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EFNB1P98172 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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