Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms