Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms